Πέραν της μελέτης στενώσεων στα στεφανιαία αγγεία, η αξονική τομογραφία καρδιάς μπορεί να αναδείξει και συγγενείς ανωμαλίες αυτών. Σπάνιες μεν (1- 2%) αλλά που με την αναγνώριση τους, οι εξεταζόμενοι τίθενται σε βέλτιστη καρδιολογική παρακολούθηση εφεξής. Παράδειγμα υπερεπικρατούσας δεξιάς στεφανιαίας (RCA) αρτηρίας με παράλληλη απουσία της περισπώμενης (LCx).
